Ekonomik ve Toplumsal Araştırmalar Merkezi (BETAM)
Sürekli Eğitim Merkezi (BAUSEM)
Medeniyet Araştırmaları Merkezi (MEDAM)
Gelibolu Yüzüncü Yıl Uygulama ve Araştırma Merkezi
Öğretmen Mesleki Gelişim, Uygulama ve Araştırma Merkezi (ÖGAM)
Uluslararası Liderlik Araştırma ve Uygulama Merkezi (ULMER)
Kreatif Enstitüler Araştırma ve Uygulama Merkezi
Güvenlik Araştırmaları ve Uygulama Merkezi (BAUCESS)
Toplum, Sağlık, Davranış ve Önlem Alma Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi
Mesleki Teknik Eğitimi Geliştirme Birimi (METGEM)
Türk Boğazları Uygulama ve Araştırma Merkezi
BAU Finansal Araştırma ve Uygulama Merkezi (BFRC)
Türkçe ve Yabancı Diller Uygulama ve Araştırma Merkezi
Siber Güvenlik Araştırma ve Uygulama Merkezi