Ekonomik ve Toplumsal Araştırmalar Merkezi Müdürlüğü (BETAM)
Osmanlı Tarihi Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü (OTAM)
Kreatif Endüstriler Araştırma ve Uygulama Merkezi Müdürlüğü (BAUKEM)
Medeniyet Araştırmaları Merkezi Müdürlüğü (MEDAM)
Siber Güvenlik Araştırma ve Uygulama Merkezi Müdürlüğü
Öğrenme ve Öğretme Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Öğretmen Mesleki Gelişim, Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü (ÖGAM)
Büyük Veri Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Sağlıklı Yaşam ve Fizyoterapi Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Psikoloji Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü (PUAM)
Sosyal Etki ve Sorumluluk Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Sürekli Eğitim Merkezi Müdürlüğü(BAUSEM)
Toplum, Sağlık, Davranış ve Önlem Alma Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Kuluçka ve Girişimcilik Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Türkçe ve Yabancı Diller Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü (TÜRKMER)
İstanbul Blokzincir Teknolojileri ve İnovasyon Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Uluslararası Finansal Araştırmalar Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü (BFRC)
Yöneticı ve Liderler İçin Uluslararası Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü (CIFAL)
CO-OP&Kariyer Geliştirme Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Uluslararası Liderlik Araştırma ve Uygulama Merkezi Müdürlüğü (ULMER)
Stratejik Araştırmalar Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Sürdürülebilir Gıda Sistemleri Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
İnsan Hakları Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Uzaktan Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü (BAUGO)
Asya-Pasifik-Afrika Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi
Hesaplamalı İlaç Tasarım Uygulama ve Araştırma Merkezi (HİTMER)
Dil ve Konuşma Bozuklukları Uygulama ve Araştırma Merkezi
Rekabet Hukuku Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Ahşap Yapı Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü
Göç ve Kent Çalışmaları Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlüğü (BAUMUS)
Ağız ve Diş Sağlığı Eğitim Uygulama ve Araştırma Merkezi